Bc. Tomáš Pavlík

Analyst, Tom Rebok´s Research Group

correspondence Address:
Šumavská 525/33, 602 00 Brno

e‑mail:

Basic information

Type

Total number of publications: 4

2025

GROMACS MetaDump

ROŠINEC Adrián SLANINÁKOVÁ Terézia PAVLÍK Tomáš RANDIAK Róbert SVOBODA Tomáš RAČEK Tomáš BUČEKOVÁ Gabriela SCHINDLER Ondřej ANTOL Matej KŘENEK Aleš BERKA Karel SVOBODOVÁ Radka

Software

Year: 2025
Gromacs MetaDump: a tool for extracting GROMACS simulation metadata

ROŠINEC Adrián SLANINÁKOVÁ Terézia PAVLÍK Tomáš RANDIAK Róbert SVOBODA Tomáš RAČEK Tomáš BUČEKOVÁ Gabriela SCHINDLER Ondřej ANTOL Matej KŘENEK Aleš BERKA Karel SVOBODOVÁ Radka

Article in Periodical

Journal of Cheminformatics, year: 2025, volume: 17, edition: 1, DOI
Refining Structure-Based Search in AlphaFold DB: Including confidence metrics into AlphaFind

SLANINÁKOVÁ Terézia MARŠÁLKOVÁ Eva GREŠOVÁ Katarína KŘENEK Aleš OĽHA Jaroslav PAVLÍK Tomáš ŠPRINGEROVÁ Pavlína SEHNAL David ANTOL Matej

Conference abstract

Year: 2025, type: Conference abstract

2024

Beyond Metadata: Leveraging Similarity Search in Molecular Dynamics Data

ROŠINEC Adrián PAVLÍK Tomáš SLANINÁKOVÁ Terézia KŘENEK Aleš ŠPRINGEROVÁ Pavlína ANTOL Matej SVOBODOVÁ Radka

Conference abstract

Year: 2024, type: Conference abstract